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生物芯片類檢測試劑主要質(zhì)量控制指導原則
   

生物芯片類檢測試劑主要原材料、生產(chǎn)工藝及質(zhì)量

控制注冊技術(shù)審查指導原則(報批稿)

一、前言

本指導原則的主要目的是規(guī)范申請人對生物芯片類檢測試劑的主要原材料研究資料、生產(chǎn)工藝及反應體系研究資料的準備,并對產(chǎn)品質(zhì)量控制提出指導性技術(shù)要求。

本指導原則系對生物芯片類檢測試劑的一般要求,申請人應依據(jù)產(chǎn)品特性確定其中的具體內(nèi)容是否適用,若不適用,需詳細闡述其理由及相應的科學依據(jù)。

本指導原則是對申請人和審查人員的指導性文件,但不包括注冊審批所涉及的行政事項,亦不作為法規(guī)強制執(zhí)行,如果有能夠滿足相關(guān)法規(guī)要求的其它方法,也可以采用,但是需要提供詳細的研究資料和驗證資料。應在遵循相關(guān)法規(guī)的前提下使用本指導原則。

本指導原則是在現(xiàn)行法規(guī)和標準體系以及當前認知水平下制訂的,隨著法規(guī)和標準的不斷完善,以及科學技術(shù)的不斷發(fā)展,本指導原則相關(guān)內(nèi)容也將進行適時的調(diào)整。

二、適用范圍

根據(jù)芯片制作的主要原料和方法,生物芯片可分為核酸芯片、蛋白芯片、細胞芯片、組織芯片等。本指導原則是針對核酸和蛋白為檢測靶分子生物芯片的注冊技術(shù)審查指導原則,其它類型靶分子檢測的芯片診斷試劑可參考本指導原則。

三、基本要求

(一)基本原則

1.試劑研制、生產(chǎn)用各種原料、輔料等應制定相應的質(zhì)量標準,并符合有關(guān)法規(guī)的要求。

2.試劑生產(chǎn)企業(yè)應具備相應的專業(yè)技術(shù)人員、儀器設備以及適宜的生產(chǎn)環(huán)境,獲得《醫(yī)療器械生產(chǎn)許可證》;同時,應按照《體外診斷試劑生產(chǎn)實施細則(試行)》的要求建立相應的質(zhì)量管理體系,形成文件和記錄,加以實施并保持有效運行;還應通過《體外診斷試劑生產(chǎn)企業(yè)質(zhì)量管理體系考核評定標準(試行)》的考核。

3.生物芯片類試劑在研制時,應當按照科學、規(guī)范的原則組織研發(fā),各反應條件的選擇和確定應符合基本的科學原理。

4.試劑研制、生產(chǎn)過程中所用的物料及工藝,應充分考慮可能涉及的安全性方面的事宜。

5.生產(chǎn)和質(zhì)量控制的總體目標:保證試劑使用安全、質(zhì)量穩(wěn)定、工藝可控、檢測有效。

(二)原材料質(zhì)量控制

1.核酸檢測芯片

核酸芯片檢測時,從生物樣本中提取的核酸可用熒光標記、金標記和酶標記;檢測方法包括光譜學方法和化學顯色。下面為熒光標記芯片技術(shù)指導原則,采用金標記和酶聯(lián)顯色等的生物芯片診斷試劑可參照核酸芯片和蛋白芯片相關(guān)部分。

(1)主要生物原料

核酸檢測芯片的主要生物原料包括模板DNA、dNTPs、引物、探針、標記物等。主要生物原料若為企業(yè)自己生產(chǎn),其工藝必須相對穩(wěn)定,企業(yè)應按照工藝要求對這類生物原料進行質(zhì)量檢驗,以保證其達到規(guī)定的質(zhì)量標準;若購買,其供應商要求相對固定,不能隨意變更供應商,同時,供應商應提供相應的質(zhì)量保證證明和相應的質(zhì)檢報告,達到生產(chǎn)規(guī)定的質(zhì)量標準。如果主要原料(包括工藝)或其供應商有變更,應依據(jù)國家相關(guān)法規(guī)的要求進行變更申請。

①模板DNA

重組DNA:經(jīng)測序驗證,關(guān)鍵堿基或序列沒有錯誤。1×TE溶解,濃度為100ng/μl以上,-20℃保存。作為陽性參考品時,其稀釋度由企業(yè)根據(jù)產(chǎn)品標準確定。

②dNTPs(dATP/dUTP/dGTP/dCTP/dTTP)

HPLC純,PCR級,無DNase、RNase污染,-20℃以下保存。

③引物

生產(chǎn)中的引物原材料為凍干粉,PAGE純或HPLC純。用標準DNA模板擴增,電泳檢測,譜帶單一,大小正確,與對照引物比較,產(chǎn)物量一致。符合視為合格引物,-20℃以下保存。

④探針(用于陣列制備)

重組DNA, 凍干粉(或1×TE溶解液):至少滿足一個批次的用量,酶切鑒定分析圖譜。

PCR產(chǎn)物,凍干粉(或1×TE溶解液):至少滿足一個批次的用量,PCR電泳鑒定圖譜。

合成寡核苷酸:PAGE純或HPLC純,至少滿足一個批次的用量,提供該產(chǎn)品的PAGE電泳分析圖譜或HPLC分析圖譜。

探針序列的正確性:應用克隆鑒定的標準DNA雜交鑒定或測序鑒定。

純度和濃度檢測:采用電泳方法,電泳圖譜沒有雜帶,目的條帶的強度與已知濃度的標準DNA條帶進行參比計算其強度。純度較高的DNA,可用紫外分光光度計進行定量。檢驗合格后入庫,避光、-20℃以下保存。

⑤標記物

含有激發(fā)光波長和發(fā)射光波長介于280~680nm的所有熒光分子,HPLC純。

⑥Taq DNA聚合酶

SDS-PAGE 檢測,純度>95%,具有DNA聚合酶活性,無核酸內(nèi)切酶活性;具熱穩(wěn)定性,94℃保溫1小時后仍保持50%活性。產(chǎn)品-20℃保存。

⑦尿嘧啶糖基化酶(UNG)

具尿嘧啶糖基化酶活性,無核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性。1U UNG 37℃處理3分鐘后,103拷貝以下含U模板被降解后不能產(chǎn)生擴增產(chǎn)物。產(chǎn)品-20℃保存。

⑧逆轉(zhuǎn)錄(RT) 酶

具有逆轉(zhuǎn)錄活性,無核酸內(nèi)切酶活性,-20℃保存。

⑨RT-PCR酶

具逆轉(zhuǎn)錄酶活性和DNA聚合酶活性,無核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性,94℃ 1小時后仍保持50%活性。產(chǎn)品-20℃保存。

⑩緩沖液

各類酶制品所需的反應緩沖液由廠家隨酶制品提供,-20℃保存。

(2)主要生物輔料

主要生物輔料包括酶類(蛋白酶、核酸酶等)、核酸提取試劑、魚精DNA、封閉用蛋白、雜交液等,企業(yè)應建立相應的質(zhì)量標準。主要生物輔料若為企業(yè)自己生產(chǎn)(配制),其工藝必須相對穩(wěn)定,并按照工藝要求對這類生物原料進行質(zhì)量檢驗,以保證其達到規(guī)定的質(zhì)量標準;若購買,其供應商要求相對固定,不能隨意變更供應商,同時,供應商應提供相應的質(zhì)量保證證明和相應的質(zhì)檢報告,達到生產(chǎn)規(guī)定的質(zhì)量標準。

(3)主要化學原輔料

化學原材料的質(zhì)量標準參照《中國生物制品主要原輔材料質(zhì)控標準(2000年版)》分析純級別進行檢驗。主要的檢測指標包括:溶液外觀、一般鹽類檢測、溶液pH值、溶解情況、干燥失重、熾灼殘渣等。

主要化學原材料的供應商要求相對固定,不得隨意發(fā)生變更?;瘜W原材料在購入時,原材料的生產(chǎn)商必須提供該批次化學原材料的質(zhì)量保證材料和質(zhì)檢報告,其質(zhì)量標準應達到生產(chǎn)所需的質(zhì)量標準。

(4)其他物料

①載玻片

外觀:明亮處用肉眼觀察無缺刻,無劃傷等。規(guī)格按設計要求。

激光掃描儀掃描(波長為芯片檢測波長):包被層基本均勻。

②試管、吸頭、試劑瓶等

一次性使用,由生產(chǎn)廠家提供質(zhì)量保證,達到設計要求。

③其他:

包括試劑瓶標簽、鋁箔袋、襯墊、可密封塑料袋、說明書、干燥劑和包裝外盒等,應參照國家食品藥品監(jiān)督管理局頒布的《體外診斷試劑說明書編寫指導原則》和《醫(yī)療器械說明書、標簽和包裝標識管理規(guī)定》建立相應質(zhì)量標準。

2.蛋白檢測芯片

(1)主要生物原料

與生產(chǎn)的產(chǎn)品質(zhì)量最密切相關(guān)的生物原料包括各種天然抗原、重組抗原、單克隆杭體、多克隆抗體以及多肽類生物原科。這類原料可用于點膜、標記相關(guān)酶、納米金、光學基團及中和反應用抗原或抗體等。使用前應按照工藝要求對這類生物原料進行質(zhì)量檢驗,以保證其達到規(guī)定的質(zhì)量標準。主要生物原料若為企業(yè)自己生產(chǎn),其工藝必須相對穩(wěn)定;若購買,其供應商要求相對固定,不能隨意變更供應商,如果主要原料(包括工藝)或其供應商有變更,應依據(jù)國家相關(guān)法規(guī)的要求變更申請。

主要生物原料的常規(guī)檢驗項目一般包括:

① 外觀

肉眼觀察,大部分生物原料為澄清均一液體,不含異物、渾濁或搖不散的沉淀或顆粒;或者為白色粉末,不含其他顏色雜質(zhì);特殊生物原料應具備相應外觀標準。

② 純度和分子量

生物原料經(jīng)SDS-PAGE 電泳后,利用電泳掃描儀進行分析;也可用其他適宜的方法,如高效液相法等進行分析。根據(jù)所檢測生物原料的分子量選擇適宜聚丙烯酰胺凝膠濃度進行電泳。一般每個電泳道加樣量為5μg;電泳后的凝膠可用考馬斯亮藍染色或銀染法染色。染色后的凝膠用電泳掃描儀分析原料的純度和分子量,純度應達到相應的質(zhì)量標準,分子量大小應在正確的條帶位置。

③ 蛋白濃度

蛋白濃度可通過Lowry法、280nm 光吸收法、雙縮脲法或其它適宜方法進行檢測。

④ 效價

效價的測定一般根據(jù)蛋白含量測定結(jié)果,通過倍比稀釋法進行。效價應達到規(guī)定的要求。

⑤ 功能性實驗

功能性實驗是指生物原料用于試劑盒實際生產(chǎn)中的情況,一般考查使用該原料的試劑的靈敏度、特異性和穩(wěn)定性等,并比較其與上批次原料的相關(guān)性。

(2)主要生物輔料

生物輔料指的是在生產(chǎn)過程中作為蛋白保護劑用途的一類生物原料,主要包括小牛血清、山羊血清、牛血清白蛋白和酪蛋白等。這些生物原料的質(zhì)量標準應符合《中國生物制品主要原輔材料質(zhì)控標準(2000年版)》規(guī)定的質(zhì)量標準要求,并且要適合于企業(yè)生產(chǎn)。

建議作以下檢驗:

① 牛血清或羊血清

外觀:為淺黃色澄清稍粘稠的液體,無溶血或異物

無菌試驗:將血清直接37℃放置7天,放在明亮處觀察,不得出現(xiàn)混濁或沉淀。

總蛋白含量:用雙縮脲法測定,標準為不小于32mg/ml。

球蛋白含量:取待測血清1ml,采用飽和硫酸銨法進行沉淀。沉淀溶于0.85%NaCl溶液至1ml,用Lowry法測定蛋白含量不能大于2mg/ml。

② 牛血清白蛋白:

外觀:應為淺黃色、黃色或乳白色的凍干粉末,無吸潮,無結(jié)塊,無肉眼可見的其它雜質(zhì)顆粒。

溶解性:將牛血清白蛋白配成10%溶液,溶解時間在18-26℃時應不大于15分鐘。pH值應為6.5~7.1。

總蛋白含量:用雙縮脲法測定,其標準為不小于干重的95%。

總蛋白中的BSA含量:采用硝酸纖維素膜電泳法,其標準為不小于總蛋白含量的95%。

BSA的凈含量:總蛋白含量乘總蛋白中的BSA含量,其標準為不小于90%。

③ 酪蛋白:

應符合生產(chǎn)所需的質(zhì)量標準。

④ 標記用酶

應在產(chǎn)品的質(zhì)量標準中明示所使用的標記用酶的名稱(如辣根過氧化物酶、堿性磷酸酶等),同時應根據(jù)不同生產(chǎn)廠家的檢驗方法和質(zhì)量標準進行檢驗,酶的純度RZ值(OD403nm/OD280nm)應大于3.0。

對于小牛血清或山羊血清、牛血清白蛋白以及酪蛋白等,還應進行功能性實驗,即以其為原料配制一定濃度的稀釋液作為樣品,進行測定,均不得出現(xiàn)非特異性反應。

生物輔料的供應商同樣要求相對固定,不得隨意變更供應商。

(3)化學原輔料

參照《中國生物制品主要原輔材料質(zhì)控標準(2000年版)》分析純級別進行檢驗。主要的檢測指標包括:溶液外觀、一般鹽類、溶液pH值、溶解情況、干燥失重、熾灼殘渣等。

主要化學原材料的供應商要求相對固定,不得隨意發(fā)生變更?;瘜W原材料在購入時,原材料的生產(chǎn)商必須提供該批次化學原材料的質(zhì)量保證材料和質(zhì)檢報告,其質(zhì)量標準應達到生產(chǎn)所需的質(zhì)量標準。

(4)其他物料

①基質(zhì)

以硝酸纖維素膜為例:孔徑符合設計要求(0.45μm、0.22μm等)、均一性(厚度及毛細遷移速度±20%)、尺寸(與標識吻合)

②試劑瓶和干燥劑

由生產(chǎn)廠家提供質(zhì)量保證,達到規(guī)定要求。

③其他:說明書、包裝外盒等

應參照國家食品藥品監(jiān)督管理局頒布的《體外診斷試劑說明書編寫指導原則》和《醫(yī)療器械說明書、標簽和包裝標識管理規(guī)定》建立相應質(zhì)量控制標準,如數(shù)量、規(guī)格等。

(三)試劑盒各組分的生產(chǎn)

生物芯片主要包括DNA芯片、蛋白芯片、組織芯片和細胞芯片等。生物芯片診斷試劑產(chǎn)品基本可分成二個部分,一部分是芯片,另一部分檢測用工作液。如果有配套的檢測儀器,還需對儀器及處理軟件的應用加以說明。

1.芯片的生產(chǎn)

芯片生產(chǎn)的基本過程包括探針的獲取方法,純化,點樣,固定。

(1)探針獲取

不同芯片,主要是探針不同,生物芯片的探針主要包括以下幾類,其它探針可參考制定相應的技術(shù)及質(zhì)量標準。

① DNA探針的獲取

探針的形式包括PCR產(chǎn)物、克隆DNA、人工合成DNA片段等;要求有生產(chǎn)程序和質(zhì)量指標及檢測方法,要進行純化,有固定的純化程序。

② 抗原的生產(chǎn)

抗原獲得方法包括細胞培養(yǎng)、從生物材料中分離提取、基因工程表達以及合成肽等。基因工程表達產(chǎn)物又分為純抗原蛋白、融合蛋白等。

③ 抗體

抗體分單克隆抗體和多克隆抗體。抗體制備包括細胞培養(yǎng),動物腹水,基因工程表達等方式。

④ 細胞和組織

包括細胞或組織類型,固定方法。組織材料包括固定,包埋,切片等。

(2)陣列的排列設計

陣列的排列可以是依次排列、隨機排列、對角線排列以及其它排列方式,但設計時需考慮重復次數(shù)和對照等因素。

(3)點陣的制作

使用儀器的需要確定型號,程序;手工制作的也應有標準操作程序。

(4)固定:包括固定方式,固定條件等。

應對芯片生產(chǎn)的過程進行相應的質(zhì)量控制,如點樣和固定過程的監(jiān)控、點樣均一性檢驗等。

2.工作液配制

(1)芯片生產(chǎn)所需試劑,包括細胞培養(yǎng)基,探針制備試劑,陣列制作和固定試劑等。

(2)樣品處理試劑,芯片檢測靶分子分為核酸和蛋白質(zhì)。檢測核酸的樣品處理試劑包括臨床取樣,DNA提取或RNA提取試劑,逆轉(zhuǎn)錄試劑,PCR擴增試劑,核酸標記試劑等;檢測蛋白的處理試劑包括取樣試劑,蛋白稀釋液以及特殊試劑等。

(3)反應液:檢測核酸時的反應液包括預雜交液,雜交液,洗脫液等;檢測蛋白時,包括封閉液,抗原/抗體反應液,洗脫液,顯色液,顯色終止液等。

3.數(shù)據(jù)判讀

(1)判斷標準及依據(jù),包括Cut off值的確定依據(jù)。

(2)數(shù)據(jù)判讀方式:人工還是軟件判讀。

(3)如果是軟件判讀,應提供軟件判斷的科學依據(jù)(包括生物學原理、數(shù)據(jù)獲取原理和判斷實驗是否成立的依據(jù))以及實驗測試的原始報告(或數(shù)據(jù)),并需要說明:

①軟件的來源:購買或自己編制,是否獲得注冊等。

②軟件的用途:包括對數(shù)據(jù)的分析、存儲、解讀、含義等。

③軟件的使用:基本的使用程序。

(四)半成品質(zhì)量控制

1.抽樣

檢驗人員按批號抽取檢驗需要數(shù)量的半成品,作好標記,待檢。

2.半成品檢驗

利用上一批檢驗合格的試劑盒的相應組分,對本批生產(chǎn)出的各種試劑盒組分分別進行檢驗,檢驗結(jié)果達到產(chǎn)品的質(zhì)量標準。

半成品檢驗,一般使用國家標準品(參考品)或經(jīng)國家標準品(參考品)標化后的企業(yè)參考品進行。若某類試劑沒有國家標準品(參考品),則使用企業(yè)參考品,企業(yè)參考品的制備應有規(guī)范的質(zhì)量控制程序,以保證產(chǎn)品的安全性、有效性及質(zhì)量可控,其質(zhì)量應不低于國家食品藥品監(jiān)督管理局已經(jīng)批準的同類產(chǎn)品的質(zhì)量。

檢測所抽樣的半成品試劑盒的性能,包括陰/陽性參考品的符合率、靈敏度(最低檢出量)、精密性等,均應達到相應質(zhì)量標準的要求。精密性用比最低檢測限高一個數(shù)量級的質(zhì)控品,重復檢測10次,判定結(jié)果一致。對定量檢測試劑,同時應分析其線性相關(guān)系數(shù)和校準品檢測結(jié)果的準確性。

企業(yè)應該對每一批試劑的半成品進行穩(wěn)定性測試。穩(wěn)定性試驗可在在特定溫度或特定條件下完成。對蛋白芯片,應完成37℃熱穩(wěn)定性試驗,試驗結(jié)果應符合產(chǎn)品的質(zhì)量標準。

(五)成品質(zhì)量控制

產(chǎn)品包裝完成后,質(zhì)檢人員根據(jù)試劑的批號、實際包裝量、抽樣申請單的要求進行抽樣,同時填寫抽樣數(shù)量和抽樣日期,并且由抽樣人簽名。抽樣數(shù)量應包括檢驗用數(shù)量和留樣數(shù)量。質(zhì)檢人員同時應檢查相關(guān)原始記錄。

每一批生物芯片類診斷試劑報批批量不少于2000人份。

1.成品檢驗

一般使用國家標準品(參考品)或經(jīng)國家標準品(參考品)標化后的企業(yè)參考品進行。若某類試劑沒有國家標準品(參考品),則使用企業(yè)參考品,企業(yè)參考品的制備應有規(guī)范的質(zhì)量控制程序,以保證產(chǎn)品的安全性、有效性及質(zhì)量可控,其質(zhì)量應不低于國家食品藥品監(jiān)督管理局已經(jīng)批準的同類產(chǎn)品的質(zhì)量。

2.穩(wěn)定性試驗

試劑批放行前,應完成穩(wěn)定性試驗。穩(wěn)定性試驗可在特定溫度或特定條件下完成。對蛋白芯片,每批試劑批放行前,應完成37℃熱穩(wěn)定性試驗,達到相應的質(zhì)量標準。


四、名詞解釋

生物芯片類檢測試劑:本指導原則所定義的生物芯片檢測試劑是指將多個生物探針(包括DNA片段,寡核苷酸、抗原、抗體,組織,細胞等)按預先設計的排列方式固定在特制的基質(zhì)(包括玻璃片,尼龍膜,硝酸纖維素膜等)上,用特定的方法提取生物靶分子并進行標記,然后與固定在基質(zhì)上的生物探針特異性的結(jié)合,再用相應的檢測設備(如激光掃描儀、CCD檢測儀等)和分析方法(包括軟件)進行檢測、記錄、分析,實現(xiàn)對生物靶分子的定性或定量檢測的試劑。

五、參考文獻

1.《中國生物制品規(guī)程》(2000年版),化學工業(yè)出版社

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